Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBP07199 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBP07199 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBP07199 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBP07199 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBP07199 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBP07199 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBP07199 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBP07199 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBP07199 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBP07199 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBP07199 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBP07199 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBP07199 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBP07199 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBP07199 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CENPBP07199 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CENPBP07199 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CENPBP07199 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBP07199 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms