Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Length 860 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LDLRP01130 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LDLRP01130 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LDLRP01130 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LDLRP01130 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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