Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CLDN9O95484 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CLDN9O95484 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CLDN9O95484 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CLDN9O95484 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CLDN9O95484 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CLDN9O95484 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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