Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB5O95377 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB5O95377 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB5O95377 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms