Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms