Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALUO43852 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALUO43852 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms