Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms