Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM3A6NNA2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms