Protein–RNA interactions for Protein: A6NGA9

TMEM202, Transmembrane protein 202, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM202A6NGA9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM202A6NGA9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms