Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms