Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms