Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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AFG3L2Q9Y4W6 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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