Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms