Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms