Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RABGEF1Q9UJ41 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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RABGEF1Q9UJ41 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RABGEF1Q9UJ41 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RABGEF1Q9UJ41 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RABGEF1Q9UJ41 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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RABGEF1Q9UJ41 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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RABGEF1Q9UJ41 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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RABGEF1Q9UJ41 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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RABGEF1Q9UJ41 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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