Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms