Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLIP2Q9UDT6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms