Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APEX2Q9UBZ4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms