Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms