Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms