Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms