Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms