Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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CYLDQ9NQC7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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