Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms