Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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