Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms