Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms