Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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