Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREX2Q9BQ50 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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