Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms