Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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COPS8Q99627 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS8Q99627 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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