Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms