Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB3IPQ96QF0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms