Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms