Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms