Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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UBXN4Q92575 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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UBXN4Q92575 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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UBXN4Q92575 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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