Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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ZNF548Q8NEK5 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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ZNF548Q8NEK5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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ZNF548Q8NEK5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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ZNF548Q8NEK5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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