Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BBOF1Q8ND07 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBOF1Q8ND07 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms