Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4T0

CPA6, Carboxypeptidase A6, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA6Q8N4T0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPA6Q8N4T0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms