Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms