Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms