Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC174Q6PII3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms