Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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ZNF549Q6P9A3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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ZNF549Q6P9A3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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ZNF549Q6P9A3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ZNF549Q6P9A3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ZNF549Q6P9A3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ZNF549Q6P9A3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ZNF549Q6P9A3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ZNF549Q6P9A3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ZNF549Q6P9A3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ZNF549Q6P9A3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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