Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms