Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRAMD4Q6IC98 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms