Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC01545Q5VT33 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms