Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF628Q5EBL2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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