Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms