Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL445647.1-201ENST00000606221 3599 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC005921.3-201ENST00000623774 2151 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AVIL-201ENST00000257861 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CTH-203ENST00000411986 2044 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 YY2-201ENST00000429584 2741 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PMEL-204ENST00000548493 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 WFS1-202ENST00000503569 3255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms