Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms